Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA4P06727 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA4P06727 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA4P06727 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA4P06727 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA4P06727 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA4P06727 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA4P06727 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA4P06727 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA4P06727 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA4P06727 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA4P06727 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA4P06727 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA4P06727 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA4P06727 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA4P06727 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA4P06727 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA4P06727 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA4P06727 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA4P06727 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA4P06727 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA4P06727 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA4P06727 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA4P06727 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOA4P06727 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA4P06727 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA4P06727 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA4P06727 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA4P06727 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA4P06727 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA4P06727 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA4P06727 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA4P06727 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA4P06727 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA4P06727 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA4P06727 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA4P06727 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA4P06727 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOA4P06727 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA4P06727 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA4P06727 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA4P06727 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA4P06727 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA4P06727 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA4P06727 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA4P06727 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA4P06727 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA4P06727 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA4P06727 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA4P06727 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA4P06727 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA4P06727 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA4P06727 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA4P06727 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA4P06727 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA4P06727 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA4P06727 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA4P06727 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOA4P06727 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA4P06727 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA4P06727 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA4P06727 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA4P06727 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA4P06727 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA4P06727 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA4P06727 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA4P06727 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA4P06727 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA4P06727 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA4P06727 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOA4P06727 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA4P06727 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA4P06727 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA4P06727 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA4P06727 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA4P06727 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA4P06727 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA4P06727 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA4P06727 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA4P06727 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA4P06727 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA4P06727 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA4P06727 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA4P06727 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA4P06727 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA4P06727 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA4P06727 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA4P06727 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA4P06727 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA4P06727 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA4P06727 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA4P06727 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA4P06727 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA4P06727 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA4P06727 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA4P06727 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA4P06727 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA4P06727 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA4P06727 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA4P06727 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms