Protein–RNA interactions for Protein: P04179

SOD2, Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD2P04179 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOD2P04179 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOD2P04179 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOD2P04179 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOD2P04179 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOD2P04179 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOD2P04179 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOD2P04179 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOD2P04179 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOD2P04179 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOD2P04179 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOD2P04179 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOD2P04179 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOD2P04179 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOD2P04179 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOD2P04179 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOD2P04179 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOD2P04179 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOD2P04179 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOD2P04179 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOD2P04179 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOD2P04179 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOD2P04179 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOD2P04179 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOD2P04179 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOD2P04179 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOD2P04179 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOD2P04179 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SOD2P04179 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOD2P04179 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SOD2P04179 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOD2P04179 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SOD2P04179 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOD2P04179 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOD2P04179 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOD2P04179 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOD2P04179 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOD2P04179 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOD2P04179 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOD2P04179 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOD2P04179 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOD2P04179 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOD2P04179 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SOD2P04179 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOD2P04179 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOD2P04179 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOD2P04179 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOD2P04179 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOD2P04179 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SOD2P04179 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD2P04179 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD2P04179 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD2P04179 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD2P04179 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD2P04179 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD2P04179 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD2P04179 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD2P04179 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD2P04179 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD2P04179 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD2P04179 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD2P04179 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD2P04179 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD2P04179 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD2P04179 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD2P04179 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD2P04179 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD2P04179 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD2P04179 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOD2P04179 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOD2P04179 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOD2P04179 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOD2P04179 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOD2P04179 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOD2P04179 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOD2P04179 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOD2P04179 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOD2P04179 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOD2P04179 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOD2P04179 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOD2P04179 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOD2P04179 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOD2P04179 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOD2P04179 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOD2P04179 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOD2P04179 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOD2P04179 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOD2P04179 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOD2P04179 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOD2P04179 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOD2P04179 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOD2P04179 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SOD2P04179 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SOD2P04179 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SOD2P04179 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOD2P04179 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SOD2P04179 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOD2P04179 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOD2P04179 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOD2P04179 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms