Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC3P02656 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC3P02656 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC3P02656 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC3P02656 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC3P02656 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC3P02656 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC3P02656 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC3P02656 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC3P02656 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC3P02656 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC3P02656 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC3P02656 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC3P02656 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC3P02656 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC3P02656 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC3P02656 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC3P02656 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC3P02656 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC3P02656 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC3P02656 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC3P02656 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC3P02656 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC3P02656 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC3P02656 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC3P02656 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC3P02656 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC3P02656 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC3P02656 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC3P02656 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC3P02656 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC3P02656 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC3P02656 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC3P02656 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC3P02656 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC3P02656 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms