Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOC2P02655 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOC2P02655 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOC2P02655 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOC2P02655 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC2P02655 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC2P02655 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC2P02655 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC2P02655 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC2P02655 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC2P02655 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC2P02655 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC2P02655 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC2P02655 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC2P02655 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC2P02655 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC2P02655 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC2P02655 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC2P02655 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC2P02655 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC2P02655 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC2P02655 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC2P02655 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC2P02655 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC2P02655 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC2P02655 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC2P02655 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC2P02655 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC2P02655 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC2P02655 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC2P02655 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC2P02655 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC2P02655 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC2P02655 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC2P02655 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC2P02655 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC2P02655 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC2P02655 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC2P02655 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC2P02655 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC2P02655 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC2P02655 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC2P02655 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC2P02655 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC2P02655 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC2P02655 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC2P02655 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC2P02655 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC2P02655 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC2P02655 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC2P02655 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC2P02655 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC2P02655 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC2P02655 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC2P02655 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC2P02655 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC2P02655 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC2P02655 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC2P02655 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC2P02655 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC2P02655 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC2P02655 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC2P02655 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC2P02655 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC2P02655 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC2P02655 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC2P02655 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC2P02655 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC2P02655 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC2P02655 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC2P02655 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC2P02655 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC2P02655 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC2P02655 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC2P02655 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC2P02655 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC2P02655 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC2P02655 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOC2P02655 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOC2P02655 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOC2P02655 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOC2P02655 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APOC2P02655 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOC2P02655 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOC2P02655 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOC2P02655 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOC2P02655 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOC2P02655 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOC2P02655 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOC2P02655 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOC2P02655 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOC2P02655 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC2P02655 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC2P02655 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC2P02655 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC2P02655 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC2P02655 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC2P02655 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC2P02655 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC2P02655 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms