Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD3O95983 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD3O95983 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD3O95983 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD3O95983 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD3O95983 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD3O95983 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD3O95983 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD3O95983 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD3O95983 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD3O95983 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD3O95983 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD3O95983 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD3O95983 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD3O95983 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD3O95983 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD3O95983 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD3O95983 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD3O95983 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MBD3O95983 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD3O95983 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD3O95983 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD3O95983 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD3O95983 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD3O95983 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD3O95983 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD3O95983 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD3O95983 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD3O95983 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD3O95983 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD3O95983 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD3O95983 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MBD3O95983 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MBD3O95983 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD3O95983 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD3O95983 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD3O95983 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD3O95983 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD3O95983 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD3O95983 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD3O95983 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD3O95983 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD3O95983 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD3O95983 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD3O95983 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD3O95983 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD3O95983 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD3O95983 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD3O95983 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD3O95983 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD3O95983 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MBD3O95983 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD3O95983 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD3O95983 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD3O95983 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD3O95983 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD3O95983 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD3O95983 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD3O95983 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD3O95983 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD3O95983 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MBD3O95983 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD3O95983 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD3O95983 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD3O95983 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD3O95983 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD3O95983 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD3O95983 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD3O95983 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD3O95983 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD3O95983 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MBD3O95983 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD3O95983 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD3O95983 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD3O95983 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD3O95983 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD3O95983 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD3O95983 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD3O95983 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD3O95983 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD3O95983 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MBD3O95983 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD3O95983 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD3O95983 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD3O95983 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD3O95983 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD3O95983 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD3O95983 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD3O95983 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD3O95983 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD3O95983 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD3O95983 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD3O95983 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD3O95983 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MBD3O95983 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD3O95983 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD3O95983 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD3O95983 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD3O95983 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MBD3O95983 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms