Protein–RNA interactions for Protein: O95502

NPTXR, Neuronal pentraxin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTXRO95502 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPTXRO95502 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPTXRO95502 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms