Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR4O95473 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR4O95473 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms