Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG12O94817 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATG12O94817 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATG12O94817 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATG12O94817 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG12O94817 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG12O94817 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG12O94817 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG12O94817 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG12O94817 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG12O94817 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG12O94817 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG12O94817 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG12O94817 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG12O94817 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG12O94817 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG12O94817 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG12O94817 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG12O94817 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG12O94817 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG12O94817 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG12O94817 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG12O94817 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG12O94817 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG12O94817 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG12O94817 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG12O94817 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG12O94817 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG12O94817 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG12O94817 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG12O94817 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG12O94817 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG12O94817 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG12O94817 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG12O94817 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG12O94817 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG12O94817 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG12O94817 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG12O94817 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG12O94817 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG12O94817 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG12O94817 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG12O94817 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG12O94817 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG12O94817 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG12O94817 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG12O94817 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG12O94817 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG12O94817 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG12O94817 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG12O94817 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG12O94817 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG12O94817 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG12O94817 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG12O94817 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG12O94817 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG12O94817 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG12O94817 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG12O94817 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG12O94817 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG12O94817 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG12O94817 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG12O94817 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG12O94817 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG12O94817 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG12O94817 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG12O94817 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG12O94817 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG12O94817 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG12O94817 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG12O94817 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG12O94817 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG12O94817 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG12O94817 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG12O94817 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG12O94817 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG12O94817 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG12O94817 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG12O94817 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATG12O94817 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms