Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP9O75884 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP9O75884 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 257.9 ms