Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP2O75563 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms