Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGR5O75473 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LGR5O75473 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LGR5O75473 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGR5O75473 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGR5O75473 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGR5O75473 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGR5O75473 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGR5O75473 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGR5O75473 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGR5O75473 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGR5O75473 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGR5O75473 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGR5O75473 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGR5O75473 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LGR5O75473 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGR5O75473 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LGR5O75473 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGR5O75473 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGR5O75473 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGR5O75473 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGR5O75473 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGR5O75473 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGR5O75473 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGR5O75473 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGR5O75473 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGR5O75473 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGR5O75473 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGR5O75473 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGR5O75473 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGR5O75473 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGR5O75473 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGR5O75473 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGR5O75473 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGR5O75473 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGR5O75473 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGR5O75473 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LGR5O75473 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LGR5O75473 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGR5O75473 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGR5O75473 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGR5O75473 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGR5O75473 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGR5O75473 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGR5O75473 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGR5O75473 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGR5O75473 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGR5O75473 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGR5O75473 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGR5O75473 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LGR5O75473 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGR5O75473 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGR5O75473 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGR5O75473 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGR5O75473 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGR5O75473 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGR5O75473 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGR5O75473 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGR5O75473 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGR5O75473 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGR5O75473 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGR5O75473 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGR5O75473 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGR5O75473 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGR5O75473 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGR5O75473 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGR5O75473 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGR5O75473 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGR5O75473 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGR5O75473 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGR5O75473 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGR5O75473 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGR5O75473 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGR5O75473 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGR5O75473 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LGR5O75473 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LGR5O75473 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGR5O75473 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGR5O75473 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGR5O75473 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LGR5O75473 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGR5O75473 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LGR5O75473 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGR5O75473 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGR5O75473 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGR5O75473 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LGR5O75473 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LGR5O75473 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LGR5O75473 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LGR5O75473 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGR5O75473 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGR5O75473 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGR5O75473 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGR5O75473 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGR5O75473 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LGR5O75473 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGR5O75473 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGR5O75473 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGR5O75473 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LGR5O75473 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms