Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBNO60934 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBNO60934 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBNO60934 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBNO60934 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBNO60934 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBNO60934 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBNO60934 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBNO60934 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NBNO60934 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBNO60934 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBNO60934 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBNO60934 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBNO60934 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBNO60934 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBNO60934 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBNO60934 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBNO60934 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NBNO60934 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBNO60934 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NBNO60934 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBNO60934 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NBNO60934 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NBNO60934 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NBNO60934 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NBNO60934 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBNO60934 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBNO60934 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBNO60934 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBNO60934 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBNO60934 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBNO60934 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NBNO60934 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBNO60934 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBNO60934 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBNO60934 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBNO60934 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBNO60934 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBNO60934 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBNO60934 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBNO60934 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBNO60934 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBNO60934 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBNO60934 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBNO60934 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBNO60934 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBNO60934 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBNO60934 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NBNO60934 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBNO60934 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBNO60934 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBNO60934 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBNO60934 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBNO60934 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBNO60934 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBNO60934 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBNO60934 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBNO60934 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBNO60934 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBNO60934 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBNO60934 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBNO60934 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NBNO60934 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBNO60934 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBNO60934 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBNO60934 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBNO60934 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NBNO60934 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBNO60934 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBNO60934 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBNO60934 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBNO60934 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBNO60934 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBNO60934 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBNO60934 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBNO60934 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NBNO60934 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBNO60934 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NBNO60934 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBNO60934 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NBNO60934 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBNO60934 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBNO60934 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBNO60934 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBNO60934 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBNO60934 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBNO60934 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBNO60934 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBNO60934 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBNO60934 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBNO60934 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBNO60934 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NBNO60934 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBNO60934 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBNO60934 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBNO60934 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBNO60934 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBNO60934 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBNO60934 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBNO60934 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms