Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSVO60911 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSVO60911 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSVO60911 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSVO60911 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSVO60911 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSVO60911 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSVO60911 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSVO60911 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSVO60911 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSVO60911 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSVO60911 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSVO60911 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSVO60911 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTSVO60911 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSVO60911 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSVO60911 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSVO60911 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSVO60911 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSVO60911 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSVO60911 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSVO60911 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSVO60911 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSVO60911 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTSVO60911 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTSVO60911 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTSVO60911 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTSVO60911 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSVO60911 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSVO60911 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSVO60911 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSVO60911 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSVO60911 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSVO60911 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSVO60911 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSVO60911 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSVO60911 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSVO60911 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSVO60911 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSVO60911 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSVO60911 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSVO60911 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSVO60911 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSVO60911 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSVO60911 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSVO60911 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSVO60911 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSVO60911 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSVO60911 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSVO60911 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSVO60911 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSVO60911 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSVO60911 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSVO60911 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSVO60911 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSVO60911 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSVO60911 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSVO60911 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSVO60911 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSVO60911 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSVO60911 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSVO60911 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSVO60911 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSVO60911 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSVO60911 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSVO60911 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSVO60911 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSVO60911 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSVO60911 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSVO60911 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSVO60911 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSVO60911 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSVO60911 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSVO60911 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSVO60911 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSVO60911 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSVO60911 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSVO60911 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSVO60911 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSVO60911 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms