Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC43.54■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC43.53■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
ABCC9O60706 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC43.49■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC43.48■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC43.46■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
ABCC9O60706 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.43■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC43.43■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC43.42■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.42■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC43.4■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC43.38■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC43.38■■■■■ 4.54
ABCC9O60706 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms