Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNT1O60563 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNT1O60563 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms