Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP104O60308 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP104O60308 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP104O60308 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP104O60308 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP104O60308 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP104O60308 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP104O60308 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP104O60308 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP104O60308 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP104O60308 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP104O60308 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP104O60308 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP104O60308 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP104O60308 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP104O60308 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP104O60308 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP104O60308 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP104O60308 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP104O60308 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP104O60308 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP104O60308 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP104O60308 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP104O60308 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP104O60308 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP104O60308 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP104O60308 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP104O60308 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP104O60308 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP104O60308 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP104O60308 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP104O60308 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP104O60308 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP104O60308 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP104O60308 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP104O60308 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP104O60308 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP104O60308 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP104O60308 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP104O60308 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP104O60308 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP104O60308 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP104O60308 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP104O60308 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP104O60308 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP104O60308 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP104O60308 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP104O60308 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP104O60308 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP104O60308 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP104O60308 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP104O60308 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP104O60308 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP104O60308 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP104O60308 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP104O60308 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP104O60308 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP104O60308 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP104O60308 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP104O60308 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP104O60308 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP104O60308 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP104O60308 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP104O60308 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP104O60308 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP104O60308 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP104O60308 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP104O60308 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP104O60308 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP104O60308 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP104O60308 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP104O60308 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP104O60308 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEP104O60308 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP104O60308 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP104O60308 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP104O60308 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP104O60308 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP104O60308 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP104O60308 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP104O60308 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP104O60308 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP104O60308 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP104O60308 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP104O60308 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP104O60308 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP104O60308 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP104O60308 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP104O60308 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP104O60308 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP104O60308 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP104O60308 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP104O60308 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP104O60308 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP104O60308 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP104O60308 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP104O60308 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP104O60308 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP104O60308 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP104O60308 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms