Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ2O43526 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ2O43526 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ2O43526 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ2O43526 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ2O43526 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ2O43526 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNQ2O43526 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ2O43526 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms