Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEFVO15553 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEFVO15553 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEFVO15553 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEFVO15553 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MEFVO15553 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEFVO15553 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEFVO15553 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEFVO15553 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEFVO15553 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEFVO15553 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEFVO15553 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEFVO15553 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEFVO15553 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEFVO15553 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEFVO15553 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEFVO15553 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEFVO15553 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEFVO15553 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEFVO15553 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEFVO15553 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEFVO15553 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEFVO15553 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEFVO15553 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEFVO15553 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEFVO15553 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEFVO15553 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEFVO15553 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEFVO15553 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEFVO15553 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEFVO15553 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEFVO15553 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEFVO15553 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEFVO15553 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEFVO15553 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEFVO15553 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEFVO15553 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEFVO15553 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEFVO15553 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MEFVO15553 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MEFVO15553 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEFVO15553 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEFVO15553 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEFVO15553 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEFVO15553 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MEFVO15553 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEFVO15553 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEFVO15553 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEFVO15553 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEFVO15553 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEFVO15553 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEFVO15553 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEFVO15553 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEFVO15553 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEFVO15553 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEFVO15553 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEFVO15553 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEFVO15553 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEFVO15553 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEFVO15553 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEFVO15553 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEFVO15553 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEFVO15553 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEFVO15553 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEFVO15553 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEFVO15553 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEFVO15553 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEFVO15553 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEFVO15553 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEFVO15553 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEFVO15553 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEFVO15553 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEFVO15553 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEFVO15553 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEFVO15553 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEFVO15553 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEFVO15553 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEFVO15553 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEFVO15553 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEFVO15553 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEFVO15553 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEFVO15553 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEFVO15553 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEFVO15553 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEFVO15553 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEFVO15553 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEFVO15553 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEFVO15553 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEFVO15553 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEFVO15553 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEFVO15553 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEFVO15553 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEFVO15553 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEFVO15553 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEFVO15553 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MEFVO15553 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEFVO15553 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEFVO15553 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEFVO15553 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEFVO15553 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms