Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP3O14828 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP3O14828 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms