Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS1O00470 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS1O00470 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS1O00470 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS1O00470 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS1O00470 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS1O00470 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS1O00470 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS1O00470 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS1O00470 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS1O00470 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS1O00470 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS1O00470 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS1O00470 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS1O00470 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS1O00470 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS1O00470 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS1O00470 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS1O00470 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms