Protein–RNA interactions for Protein: O00160

MYO1F, Unconventional myosin-If, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1FO00160 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYO1FO00160 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYO1FO00160 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYO1FO00160 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYO1FO00160 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYO1FO00160 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYO1FO00160 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYO1FO00160 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYO1FO00160 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYO1FO00160 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYO1FO00160 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYO1FO00160 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYO1FO00160 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYO1FO00160 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYO1FO00160 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYO1FO00160 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYO1FO00160 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYO1FO00160 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYO1FO00160 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms