Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms