Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QW42 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QW42 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QW42 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QW42 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QW42 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QW42 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QW42 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QW42 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QW42 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QW42 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QW42 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QW42 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QW42 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QW42 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QW42 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QW42 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QW42 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QW42 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QW42 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QW42 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QW42 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QW42 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QW42 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QW42 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QW42 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QW42 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QW42 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QW42 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QW42 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QW42 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QW42 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QW42 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QW42 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QW42 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QW42 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QW42 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QW42 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QW42 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QW42 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QW42 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QW42 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QW42 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QW42 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QW42 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QW42 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QW42 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QW42 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QW42 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QW42 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QW42 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QW42 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QW42 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QW42 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QW42 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QW42 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QW42 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QW42 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QW42 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QW42 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QW42 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QW42 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QW42 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QW42 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QW42 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QW42 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QW42 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QW42 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QW42 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QW42 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QW42 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QW42 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QW42 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QW42 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QW42 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QW42 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QW42 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QW42 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QW42 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QW42 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QW42 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QW42 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QW42 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QW42 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QW42 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QW42 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QW42 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QW42 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QW42 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QW42 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QW42 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QW42 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
J3QW42 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
J3QW42 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QW42 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QW42 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QW42 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QW42 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QW42 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QW42 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms