Protein–RNA interactions for Protein: F8W735

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W735 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8W735 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
F8W735 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
F8W735 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8W735 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8W735 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8W735 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8W735 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8W735 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8W735 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8W735 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8W735 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8W735 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8W735 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8W735 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8W735 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8W735 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8W735 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8W735 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8W735 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8W735 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8W735 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
F8W735 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8W735 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8W735 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8W735 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8W735 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8W735 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8W735 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8W735 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8W735 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8W735 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8W735 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8W735 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8W735 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8W735 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8W735 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8W735 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8W735 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8W735 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8W735 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8W735 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8W735 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
F8W735 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
F8W735 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8W735 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8W735 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8W735 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8W735 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8W735 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
F8W735 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8W735 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
F8W735 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
F8W735 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
F8W735 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8W735 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8W735 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8W735 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8W735 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8W735 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8W735 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8W735 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8W735 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8W735 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8W735 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8W735 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8W735 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8W735 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8W735 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
F8W735 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8W735 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8W735 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8W735 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8W735 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
F8W735 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8W735 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms