Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRDCB7Z8K6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRDCB7Z8K6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms