Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF879B4DU55 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF879B4DU55 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 309.7 ms