Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BECN2A8MW95 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BECN2A8MW95 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN2A8MW95 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN2A8MW95 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN2A8MW95 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN2A8MW95 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN2A8MW95 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN2A8MW95 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN2A8MW95 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN2A8MW95 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN2A8MW95 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN2A8MW95 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN2A8MW95 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN2A8MW95 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN2A8MW95 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN2A8MW95 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN2A8MW95 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN2A8MW95 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN2A8MW95 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms