Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYSRT1A8MQ03 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYSRT1A8MQ03 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms