Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC169A6NNP5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms