Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF233A6NK53 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF233A6NK53 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms