Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms