Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SSPOA2VEC9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms