Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBA6A0AVT1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms