Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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