Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC61Q9Y6R9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC61Q9Y6R9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC61Q9Y6R9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC61Q9Y6R9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC61Q9Y6R9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC61Q9Y6R9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC61Q9Y6R9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC61Q9Y6R9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC61Q9Y6R9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC61Q9Y6R9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC61Q9Y6R9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC61Q9Y6R9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC61Q9Y6R9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC61Q9Y6R9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC61Q9Y6R9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC61Q9Y6R9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms