Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLIC4Q9Y696 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC4Q9Y696 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms