Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF2Q9Y5W3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF2Q9Y5W3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms