Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A3BPQ9Y5P4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A3BPQ9Y5P4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms