Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLXND1Q9Y4D7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXND1Q9Y4D7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms