Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9Y3F1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9Y3F1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms