Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPL11Q9Y3B7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL11Q9Y3B7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms