Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTP11Q9Y3A2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UTP11Q9Y3A2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTP11Q9Y3A2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTP11Q9Y3A2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTP11Q9Y3A2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UTP11Q9Y3A2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTP11Q9Y3A2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTP11Q9Y3A2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTP11Q9Y3A2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTP11Q9Y3A2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP11Q9Y3A2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UTP11Q9Y3A2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTP11Q9Y3A2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms