Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX24Q9Y343 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX24Q9Y343 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms