Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP3Q9Y2W7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms