Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC2Q9Y235 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC2Q9Y235 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms