Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HDAC5Q9UQL6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms