Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PHF8Q9UPP1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms