Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX12Q9UMY4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms