Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BARX2Q9UMQ3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BARX2Q9UMQ3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms