Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA11Q9UKX5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms